おはようございます、山本 怜さん
After Effects CS6をご使用とのことですので、数年来正常に使用できていて最近この症状が発生したのではないかと思います。
推定ですが、最近次の①または②を行いませんでしたか。
①OSをMac OS X v10.11.5にバージョンアップした。
②OSがMac OS X v10.11.5プリインストールのPCを購入し、After Effects CS6をインストールした。
After Effects CS6の動作保証OSは「Mac OS X v10.6.8、v10.7、v10.8、または v10.9 日本語版」です（下記リンク）。Mac OS X v10.11.5は動作保証されていませんので、正常に動作しない可能性があります。
推定ですが、OSを新しいバージョンにしたことが原因だと思います。
https://helpx.adobe.com/jp/after-effects/system-requirements.html#After%20Effects%20CS6%20の必要システム構成
対応策
・OSを元のバージョンに戻します。
・新しいOSを使用するとすれば、After EffectsをCC2015にバージョンアップします。