Windowsで読み込む方法がわかりました。
After Effects ＜ファイル＞ → ＜読み込み＞ → ＜Pro Import Aftter Effects…＞
上記のメニューから、Motion・Final Cut Pro等のファイルを読み込めます。
古いバージョンだと、「Automatic Duck」という別売りのプラグインが必要だったのが、CS6からアドビが買収して標準機能になっています。
Windows版のCC2017はインストールしていないので確認していませんが、CC2015には搭載されています。
CC2017をお持ちなら、確認してください。